Хорошая статья, спасибо!
Согласен с большинством утверждений.
Ощущения от Create React App двойственные — с одной стороны много удобных вещей, с другой не всё нравится. Наверное хороший вариант это создание собственного Boilerplate. Минусом будет то, что его придется поддерживать в актуальном состоянии.